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广东空间代谢组学在医药应用

更新时间:2025-08-23      点击次数:6

空间代谢组学:伦敦帝国理工学院George B Hanna教授团队及合作者在《Cancer Research》发表了题为“De novo lipogenesis alters the phospholipidome of esophageal adenocarcinoma"的研究成果,该研究整合磷脂代谢组学、空间代谢组学和遗传学方法,旨在阐明食管腺*的磷脂代谢重编程,对探索与疾病诊断相关的磷脂生物标志物具有重要意义。中文标题:脂质从头合成改变食管腺*磷脂代谢研究对象:食管腺*发表期刊:CancerResearch影响因子:12.701发表单位:伦敦帝国理工学院运用生物技术:空间代谢组学空间代谢组技术流程 。广东空间代谢组学在医药应用

队列1:收集手术切除的食管腺*(EA)组织和与之匹配的健康食管上皮组织(MHEE)。队列2:收集健康食管上皮组织(来自健康志愿者,HEE)和未经***的食管炎(IEE)、巴雷特化生(BM)、巴雷特增生(BD)和食管腺*(EA)活检样本,用于发现食管腺*发展进程中甘油磷脂的变化,以及队列1的外部验证。样本制备:样本制成冰冻组织切片,并结合H&E染色。研究方法:空间代谢组学;qPCR检测甘油磷脂合成通路中基因的表达;细胞转染沉默ACYL基因;免疫组化用于分析队列1样本中脂肪酸从头合成通路关键酶的表达。吉林空间代谢组学在医学空间代谢组学二维乃至三维的水平,极大拓展了对组学样品信息的认知。

AFADESI-MSI空间代谢组学:中文标题:一种基于分子组织学的高灵敏高覆盖质谱成像方法用于检测功能性代谢物研究对象:大鼠肾脏,大鼠脑和人食道*组织发表期刊:AdvancedScience影响因子:16.806运用生物技术:AFADESI-MSI空间代谢组学2018年11月中国医学科学院药物研究所再帕尔·阿不力孜教授、贺玖明研究员课题组在Advanced Science发表的研究论文,通过优化的空气动力辅助解吸电喷雾质谱成像(AFADESI-MSI)技术,绘制了生物样本中超过1500种代谢物的空间分布图谱,将功能代谢物的时空变化与组织结构和生物功能联系起来。本研究开发了一种灵敏且覆盖度广的AFADESI-MSI方法,用于原位分析组织上的代谢物并发现特异性生物标志物。通过非靶向分析,在大鼠脑、肾脏和人食道*组织中观察到数千种代谢物,为分子组织学研究提供了有力的分析工具。

空间代谢组的成像。生成空间代谢组谱图和拉曼相关图,从而能够将振动光谱检测到的结构特征分配给通过质谱检测到的单个分子物种(图3D,E)。一般说来,数据显示了与多种不同脂质相关的拉曼振动峰之间的高度相关性。由于可以获得很好的相关性,作者随后对拉曼光谱和质谱进行了PLS多元回归。用作为例子,作者回归了m/z844.52pC(38:6)的拉曼光谱。回归载体显示高度特异的脂峰,表明对磷脂酰胆碱具有特异性(图3F)。回归分析表明,可建立高度线性关系(校正R2=0.825)(图3G)。假设在一级近似下质谱与浓度的线性关系,这个基于拉曼的模型可以作为复杂组织中特定脂质种类的预测因子。这些结果**了使用基于结构和生物分子信息的互补光谱模式的脂肪组谱的新证明。空间代谢组技术原理 。

AFADESI-MSI空间代谢组学分析了对照组和东莨菪碱***的大鼠矢状脑切片,将发现的代谢物***映射代谢网络,并通过代谢组学分析发现空间代谢变化。不仅可以对药物准确定量,还可以检测代谢网络相关的数百种内源性代谢物在大脑特定区域的分布。图5显示了代谢网络中检测到的各种代谢物,以及在不同大脑微区代谢物的明显改变。如图5A所示,找到三种代谢物(N-甲酰基尿氨酸、L-色氨酸和5-羟色氨酸),属于色氨酸代谢途径,意味着东莨菪碱会干扰色氨酸的代谢过程。作者分析了东莨菪碱***组大鼠脑的十个微区,发现脑桥中有16种表达异常的代谢产物,而在大脑皮层中发现了7种。表明在东莨菪碱***下,脑桥和大脑皮层可能是受影响**严重的区域。空间代谢组相关技术服务,经验丰富。陕西玉米空间代谢组学

蛋白质组学的研究方法。广东空间代谢组学在医药应用

鹿明生物空间代谢组学项目实测结果1、可实现代谢物定性数量:1000-3000个代谢物。2、定性代谢物类型:不喷涂基质,小分子物质检测不被基质抑制,定性物质约70%为700Da以下的小分子物质,30%为脂质大分子。空间多组学联合:空间代谢+空间转录2021年即拥有空间代谢组和空间转录组(欧易生物)两个平台,已执行空间代谢+空间转录联合项目10+。空间多组学检测平台2套AFADESI-MSI成像系统,分别连接QE或者QE-HF高分辨质谱仪。***套AFADESI成像系统(连接Thermo QE高分辨质谱仪)第二套AFADESI成像系统系统(连接Thermo QE-HF高分辨质谱仪)广东空间代谢组学在医药应用

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